8月文獻(xiàn)速遞 | 雙洳生物最新文獻(xiàn)分享
發(fā)布時間：
2023-10-26 15:28
截止目前，引用Lonsera產(chǎn)品發(fā)表的文獻(xiàn)共448篇，總影響因子2776.187，合作單位覆蓋了復(fù)旦、同濟、中山、南京、四川大學(xué)等上百所知名大學(xué)與研究機構(gòu)。
近期收錄2023年8月引用Lonsera產(chǎn)品發(fā)表的文獻(xiàn)共12篇，文章影響因子(IF) 總和高達(dá)109.9。其中，IF10分以上的文獻(xiàn)共4篇，最高影響因子（IF）24.1。
01. 文獻(xiàn)分享
1.1 論文標(biāo)題
接頭分子MAVS形成朊病毒樣聚集體來控制RIG-I樣受體(RLR)信號級聯(lián)
MAVS-loaded unanchored Lys63-linked polyubiquitin chains activate the RIG-I-MAVS signaling cascade
文獻(xiàn)引用產(chǎn)品：Lonsera ® FBS
影響因子（IF）=24.1
第一作者名稱：Liu Feng
通訊作者名稱：Chengjiang Gao
作者單位：山東大學(xué)
發(fā)表時間：2023-08-15
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1.2 論文摘要
銜接分子 MAVS 形成朊病毒樣聚集體來控制 RIG-I 樣受體 (RLR) 信號級聯(lián)。Lys63 (K63) 連接的多泛素化對于 MAVS 聚集至關(guān)重要，但其潛在機制以及相應(yīng)的 E3 連接酶和去泛素化酶 (DUB) 仍然難以捉摸。在這里，我們發(fā)現(xiàn)裝載在MAVS上的K63連接的多聚泛素鏈可以被RIG-I直接識別，以啟動RIG-I介導(dǎo)的MAVS聚集，前提是CARDRIG-I-CARDMAVS相互作用。有趣的是，許多 K63 連接的多聚泛素鏈通過非錨定連接連接到 MAVS。我們確定 Ube2N 是 MAVS 的主要泛素結(jié)合酶，并揭示 Ube2N 與 E3 連接酶 Riplet 和 TRIM31 配合促進(jìn) MAVS 的非錨定 K63 連接多泛素化。此外，我們確定 USP10 是一種直接 DUB，可以從 MAVS 中去除未錨定的 K63 連接的多聚泛素鏈。一致地，USP10 減弱 RIG-I 介導(dǎo)的 MAVS 聚集和 I 型干擾素的產(chǎn)生。USP10 缺陷的小鼠對 RNA 病毒感染表現(xiàn)出更強的抵抗力。我們的工作提出了一種以前未知的機制，用于激活由 MAVS 連接的非錨定 K63 連接的多聚泛素鏈觸發(fā)的 RLR 信號級聯(lián)，并建立 DUB USP10 和 E2:E3 對 Ube2N-Riplet/TRIM31 作為非錨定的特定調(diào)節(jié)系統(tǒng)病毒感染后 MAVS 的 K63 泛素化和聚集。
1.3 研究方向
MAVS負(fù)載的泛素鏈在調(diào)節(jié)RLR（RIG-I樣受體）通路激活中的作用和分子機制
1.4 實驗結(jié)果
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02. 文獻(xiàn)分享
2.1 論文標(biāo)題
單細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄的同步分析
Simultaneous profiling of chromatin architecture and transcription in single cells
文獻(xiàn)引用產(chǎn)品：Lonsera ® FBS
影響因子（IF）=16.8
第一作者名稱：Qu Jiale
通訊作者名稱：Junjun Ding
作者單位：中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院
發(fā)表時間：2023-08-14
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2.2 論文摘要
染色質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)在發(fā)育和疾病中起著至關(guān)重要的作用，這兩者都與轉(zhuǎn)錄變化有關(guān)。然而，考慮到單細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄的異質(zhì)性，三維染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)之間的調(diào)控關(guān)系很難基于大量細(xì)胞群來解釋。在這里，研究人員開發(fā)了一種單細(xì)胞、多模式組學(xué)方法，允許通過測序（單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序 (scCARE-seq)）同時檢測染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和mRNA 表達(dá)。應(yīng)用 scCARE-seq 檢查染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和從 2i 到血清單小鼠胚胎干細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄，與單細(xì)胞染色質(zhì)構(gòu)象捕獲相比，細(xì)胞簇的分離得到了改善。此外，通過scCARE-seq提取的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)定義每個細(xì)胞的細(xì)胞周期階段后，研究人員發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的周期性變化與細(xì)胞周期中的轉(zhuǎn)錄同時發(fā)生。這些發(fā)現(xiàn)凸顯了 scCARE-seq 促進(jìn)綜合分析的潛力，這可能會增進(jìn)對同一單細(xì)胞中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄的理解。
2.3 研究方向
開發(fā)和應(yīng)用一種名為scCARE-seq（單細(xì)胞染色質(zhì)可及性和RNA表達(dá)測序）的方法來研究單細(xì)胞中的3D染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)。
2.4 實驗結(jié)果
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